兔豆状囊尾蚴TpRS1基因的克隆及其序列分析

摘要 旨在研究兔豆状囊尾蚴TpRS1的功能, 根据GenBank中猪带绦虫RS1 cDNA序列设计引物, 以豆状囊尾蚴总RNA为模板, 利用RT-PCR技术首次克隆到兔豆状囊尾蚴TpRS1的完整开放阅读框序列, 并利用生物信息学软件对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和抗原位点等方面进行了预测和分析。结果表明, 兔豆状囊尾蚴TpRS1的cDNA序列为275 bp的基因片段, 该序列含有一个由258个核苷酸组成的开放阅读框, 编码85个氨基酸。其编码蛋白疏水性, 分子质量为9.6 kD, 理论等电点为9.07。TpRS1二级结构中α螺旋占70.59%, β折叠占5.88%, 其余23.53%为无规卷曲, TpRS1没有信号肽序列, 同源性分析表明与其他带科绦虫的一致性在72%以上, 系统进化分析表明与泡状带绦虫处于同一进化分支