齐口裂腹鱼白介素-1β基因的克隆及表达谱

摘要 探讨齐口裂腹鱼白介素-1β（Interleukin-1β,IL-1β）基因的基本特点。用RT-PCR方法以齐口裂腹鱼脾脏cDNA作为模板扩增IL-1β基因,用生物信息学软件分析其序列,用RT-PCR方法检测IL-1β基因在齐口裂腹鱼6种组织的表达情况。克隆获得的IL-1β序列长1 252 bp,共编码276个氨基酸。GenBank 序列号为KU886235。IL-1β蛋白相对分子量为31.25 kD,等电点5.45,预测为亲水性蛋白。二级结构主要结构元件为随机卷曲和延伸链,有4个N-糖基化位点和16个磷酸化位点。NJ法系统进化树显示,齐口裂腹鱼与鲤鱼、鲫鱼的亲缘关系最近。组织表达分析显示,IL-1β基因主要在脾脏和肾脏中表达。这为深入研究鱼IL-1β的生物学功能提供理论依据