基于条形码ITS2 序列的青天葵及其混伪品分子鉴别

摘要 通过分析青天葵及其常见混伪品的ITS2 序列，建立青天葵新型真伪鉴别方法。采用植物基因组DNA 提取试剂盒提取青天葵及其混伪品的叶片DNA，一对通用引物PCR 扩增ITS2 基因片段并直接双向测序。采用DNAMAN、ClustalX 软件拼接比对序列，MEGA4.0 软件构建NJ 树，Schultz 等建立的数据库和网站预测ITS2 序列的二级结构。结果显示，获得的12 条ITS2 序列的长度范围为203-242 bp，GC 含量范围为53.1%-71.8%。所有样品ITS2 序列比对后的长度为249 bp，其中存在226 个变异位点。青天葵种间K2P 遗传距离（1.125）远大于种内K2P 遗传距离（0.004）。基于ITS2 的序列的NJ 树和二级结构均能直观地区分青天葵及其混伪品