养殖大鲵肠道细菌多样性

纯培养分离大鲵肠道细菌，选用细菌通用引物进行16S rRNA扩增，测序后提交序列并分析；免培养方法采用试剂盒提取肠道内容物总DNA，选用细菌通用引物对总DNA进行16S rRNA扩增，构建克隆文库，对阳性克隆进行PCR-RFLP分析，用Hae Ⅲ内切酶进行片段插入性验证并进行测序，构建系统发育树。纯培养获得103个菌株，分属于16个不同的可操作分类单元(operational taxonomic units，OTUs)，系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria)。其中，变形菌门(占克隆总数 87.63%)为最优势类群。免培养结果将随机挑取的105个阳性克隆归为15个OTUs，系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)4个门。其中，变形菌门(占克隆总数的71.43%)为最优势类群。养殖大鲵肠道细菌多样性丰富，具有进一步开发研究的价值