广西壮族自治区2008 - 2009年HIV-1流行毒株基因型及其分布

目的了解广西地区目前HIV-1流行毒株的基因型及其分布。方法收集广西地区13个市294名2008-2009年新诊断的HIV感染者血浆标本和背景信息，感染途径主要为异性性传播(86.1%)。采用RT PCR法分别扩增HIV-1 gag,pol全长基因(分别为1584 by和3147 by)及enu:基因的C2V3片段(558 bp)，序列编辑后用Genotyping及Mega 5.031具确定病毒的基因型，用Simplot和Recombinant HIV-1 Drawing Tool软件进行病毒基因的重组分析。结果获得全长gag基因序列270条、全长pol基因序列246条、。enu>基因C2V3区序列223条，确定272例标本的基因型。CRFO1_AE占的比例最高(77.6% )，其次为CRF08_BC(10.7%)和CRF07_BC ( 7.4% )，有4例B(B')亚型,1例G亚型，还有7例未知重组型。性别、民族间病毒基因型分布的差异无统计学意义。7株新型重组毒株有6株以CRF01_AE为母株，嵌人B和/(或)C的片段，还有1株为CRF07_BC和CRF08_BC的二代重组。结论广西地区目前流行的HIV-1毒株以CRFO1_AE为主，并出现以CRFO1_AE为母株嵌人其他毒株基因片段的新型重组毒株，呈现基因组结构复杂化趋势