中国南方某农村地区人与猪戊型肝炎病毒的检测和部分序列分析

目的调查中国南方某农村地区戊型肝炎病毒(HEV)人株与猪株的相关性。方法应用逆转录-巢式聚合酶链法(RT-nPCR)对一般人群中HEV-IgM阳性者、急性戊型肝炎患者和当地某养猪场的猪进行HEV RNA检测，并对HEV RNA阳性标本进行克隆测序和序列分析。结果 132份猪粪便标本中13份为HEV RNA阳性；26份lgM阳性一般人群血清标本中有4份HEV RNA阳性；4例急性戊型肝炎患者中有1例的血清和粪便标本为阳性。序列分析发现该地区HEV人株与猪株在ORE2部分区域的核苷酸序列同源性为89.3%～100.0%，这10株HEV序列与HEV Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型和Ⅳ型在同一区域的核苷酸序列的同源性分别为78.7%～84.7%、83.3%～85.3%、76.0%～80.0%和84.7%～95.3%。结论该地区人群及猪群中流行的HEV同属基因Ⅳ型