湖北钉螺扩增片段长度多态性分子标记遗传多样性研究的合理样本量与分子位点数

目的探讨用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记研究湖北钉螺遗传多样性的合理样本量与分子位点数。方法 选取湖南省岳阳市遗传变异较大的肋壳钉螺为研究材料，用AFLP方法对钉螺基因组DNA进行扩增，然后分析湖北钉螺样本量和分子位点数与遗传变异信息可靠性的关系。结果 湖北钉螺样本量和分子位点数与遗传多样性信息的可靠性之间存在明显的关系。当样本量低于7只时，AFLP总位点数、多态位点数、多态位点频率、Nei’s基因多样性指数和Shannon’s信息指数变化很大，而当样本量超过30只时，这些指标值的变化趋于平稳。当AFLP分子位点数低于128时，多态位点频率、Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数以及这两个指数的标准差变化相当剧烈，当分子位点数超过338时，这些指标值的变化趋于稳定。结论 在用AFLP分子标记技术研究湖北钉螺的遗传多样性时，每个钉螺种群内的样本量最好不应低于30只，用于研究分析的分子位点数最好不低于338个