深圳市2005—2007年H1N1亚型流感病毒HAl基因分子流行病学研究

目的 探讨2005-2007年深圳市H1N1流感病毒HA1基因变异特征。方法 选取深圳市2005-2007年分离的H1N1流感毒株，提取病毒RNA，用RT-PCR扩增HA1区基因片段，产物纯化后测序并进行基因序列分析。结果 2005-2007年流感病毒分离率平均为7.16%，H1N1流感病毒在2005年和2006年的分离数占总分离数的比例分别为56.14%和66.03%，而2007年仅占3.61%。核苷酸同源性和基因进化树结果一致，2005年4月份之前分离株与A/New Caledonia/20/1999为同一分支，2005年5月份之后的分离株与A/Solomon Island/3/2006为一支，而2006-2007年分离株又与国家代表株A/GDLH/219/2006在一个分支。氨基酸序列分析显示，绝大多数的毒株均在第130位点缺失一个赖氨酸；2005年5月以后的大部分毒株出现以下氨基酸变异：T82K、Y94H、R146K、R209K、T267N，2006年5月份之后的毒株在抗原决定簇B区发生了A190T、H193Y、E195D氨基酸变异，同时也发生A区R146K的置换。但所有毒株的潜在糖基化和受体结合位点均比较保守。发现1株病毒A/SZ/68/2007具特殊性，经与参照毒株比较，其326个氨基酸中有50个发生变化，其中有11个位于抗原决定簇位点、6个位于受体结合位点，且有4个氨基酸变化导致糖基化位点丢失。结论 2005-2007年深圳市人群中至少有3个类型HA1基因不同的H1N1流感病毒株；由于氨基酸变异引起病毒发生抗原漂移，其代表株为A/GDLH/219/2006；发现的A/SZ/68/2007病毒毒株具有特殊性，其抗原特性和流行病学意义还有待探讨