浙江省啮齿动物中温州病毒的基因组学分析

目的 为了解国内发现的新型沙粒病毒（温州病毒）在温州地区啮齿类动物中的流行情况。方法 采用巢式RT-PCR方法分别对采集自温州（48份）及龙泉（156份）的啮齿动物样本筛查沙粒病毒。结果 在温州地区采集的5份啮齿动物样本中再次检测到温州病毒，阳性率为10.41%；但在龙泉地区采集的156份样本中均未发现温州病毒。分析病毒的全基因组序列发现其中4株病毒与已知的温州病毒有很高的同源性；而编号为Wencheng-Rn-288病毒株的S和L节段与已知病毒同源性分别为87.5%和91.6%，在进化树上为一独立分支，为温州病毒的新亚型。结论 温州病毒在温州地区啮齿动物中有较高的流行率，且呈多样性。鉴于在柬埔寨已发现温州病毒能引起人呼吸道疾病，因此我国应加强温州病毒的监测