云南省楚雄州汉坦病毒宿主动物及分子流行病学研究

目的 掌握汉坦病毒(HV)在云南省啮齿动物中的流行情况及其遗传特征. 方法 采用笼夜法捕鼠, 鼠肺标本用直接免疫荧光法检测HV抗原, 用RT-PCR法检测HV核酸及分型, 对产物进行序列测定, 用PHYLIP软件包进行系统发生分析. 结果 2005-2006年在云南省楚雄州10个县(市)居民区共捕获鼠类4属8种1421只, 其中褐家鼠1056只, 构成比高达74. 31%, 其次为黄胸鼠(19. 70%). 检测鼠肺组织1029份, HV抗原阳性53份, 总带病毒率为5. 15%, 带病毒鼠种为褐家鼠(5. 08%, 38/748))、黄胸鼠(5. 97%, 12/201)、大足鼠(7. 69%, 2/26)和斯氏家鼠(6. 25%, 1/16). HV汉城型(SEO)核酸检测阳性21份(褐家鼠15份, 黄胸鼠4份, 大足鼠2份). 获得的12个病毒S片段核苷酸序列与GenBank中国SEO型病毒R22、L99和HLD65株同源性较高, 为87. 1%～99. 7%;与汉滩型(HTN)76-118株同源性仅为64. 4%～69. 1%. 系统进化分析显示, 楚雄州12个病毒S片段核苷酸序列与SEO型亲缘关系较近, 与HTN型及其他型HV相距较远, 证实这12份病毒标本均为SEO型病毒, 并可分S1和S3两个亚型. 结论 首次证实楚雄州10个县(市)广泛存在以褐家鼠为主要传染源的HFRS家鼠型疫源地及SEO型病毒的流行. 分析发现SEO型不同亚型病毒的分布有其地域特点和独立性