内蒙古牙克石地区莫氏田鼠携带汉坦病毒的遗传特征分析

目的 分析内蒙古牙克石地区莫氏田鼠携带汉坦病毒（HV）的遗传特征及其与汉滩病毒（HTNV）和汉城病毒（SEOV）型HV之间的关系，确定哈巴罗夫斯克病毒（KHAV）的自然宿主。方法 采用RT-PCR检测HV核酸、特异性引物扩增S、M基因并测序及进行序列分析。结果 共捕获52只莫氏田鼠，其中5只为HV核酸阳性，带毒率为9.62%。经PCR扩增，5份HV阳性样本获得全S基因片段，2份阳性样本全M基因片段；S基因片段由1848~1861bp组成，M基因片段由3662bp组成。核苷酸序列同源性分析显示，病毒与KHAV具有高度同源性（S基因片段为92.5%~96.4%，M基因片段为88.9%~95.4%），与其他型HV的差异较大。将核蛋白（NP）和糖蛋白（GP）氨基酸序列与HTNV和SEOV进行比较，NP具有一致的二级结构，GP存在明显的差异。用全S与全M的核苷酸序列构建系统进化树，这些病毒均与KHAV聚集在一起，构成一个独立的分支。KHAV分为2个小分支，核昔酸差异＞5.3%。结论 内蒙古牙克石地区存在KHAV的流行，莫氏田鼠是KHAV的自然宿主