中国炭疽芽胞杆菌荚膜质粒基因单核昔酸多态性研究

目的 研究中国炭疽芽胞杆菌(炭疽杆菌)荚膜质粒基因单核苷酸多态性(SNP)特征.方法 选择中国不同分离年代、地点和来源的95株炭疽杆菌, 采用PCR方法扩增荚膜质粒基因上的23个SNP位点, 然后进行测序并进行聚类分析.结果 通过聚类分析, 95株炭疽杆菌可分为5个群, 23个SNP位点中17个位点相同, 6个位点存在多态性, 其中17.89％(17/95)的菌株与参考菌株Pastuer同源, 38.95％(37/95)的菌株与参考菌株Ames Ancestor同源, 其余菌株则不同于目前已知的全基因组测序菌株;3株菌在PS-34位点扩增基因片段中缺失长度约80bp的序列, 待测的SNP位点包括在该缺失片段中;9株菌株在所有SNP位点扩增阴性, 经炭疽杆菌荚膜质粒基因特异引物扩增证实这些菌株缺失荚膜质粒基因.结论 中国炭疽杆菌荚膜质粒SNP位点具有遗传稳定性和自身的特异性, 6个SNP位点可作为基因分型的指标