全球历年人甲型流感病毒H3A1抗原的分子进化研究

目的 应用生物信息学数据库和工具, 对现有的H3N2亚型人甲型流感病毒全球分离株的H3A1抗原序列进化规律进行分析研究. 方法 下载NCBI Genbank和流感病毒数据库中全部的甲型流感病毒H3A1序列, 首先用两步聚类法进行样本拆分, 随后分类绘制出完整的进化树. 结果 人H3A1序列呈现出单一主干的进化趋势, 随着时间的推移, 进化树结构和进化模型相关参数均呈现出一定的变化规律, 关键变异株的出现则无明显的地域分布特征. 结论 人流感病毒H3A1抗原的进化主要是病毒抗原漂移和人类免疫选择相互作用的结果, 新变异株的出现并未出现明显的地域倾向性, 中国华南地区不应当被认为是H3亚型新变异株的发源地