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中国7个地区诺如病毒G II.4/Sydney 2012变异株分析DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2014.02.012 Keywords: 诺如病毒,GⅡ.4基因型,变异株,衣壳蛋白基因 Abstract: 目的 分析2012--2013年冬季中国地区诺如病毒新流行株GII.4/Sydney 2012的衣壳蛋白区核苷酸与氨基酸变异特点。方法 对已获得的22份2012--2013年冬季北京地区GⅡ.4/Sydney2012株进行全衣壳蛋白区基因扩增。从GenBank检索中国其他地区的GⅡ.4/Sydney 2012株衣壳蛋白区核苷酸序列。对获得的GII.4/Sydney 2012株的衣壳蛋白区核苷酸及氨基酸序列与往年GⅡ.4流行株进行系谱分析。结果 获得中国7个地区(北京、上海、江苏、湖州、荆州、香港和台湾)的GⅡ.4/Sydney 2012株资料共38份(至少包含完整VPl核苷酸序列)。GH.4/Sydney 2012株之间VPl核苷酸差异为0.1%~3.3%,氨基酸差异为0~3.1%。系谱分析发现GⅡ.4/Sydney2012株与Apeldoorn 2008和NewOrleans 2009起自共同的分支。中国和悉尼GH.4/Sydney 2012代表株的A、D、E抗原表位氨基酸序列组合有两种:TSRN-GTT-SNT和TSRN-STT-SNT。结论 G II.4/Sydney 2012株已在中国多个地区出现,各地区病毒株同源性较高。G H.4/Sydney 2012株的抗原表位氨基酸组合发生明显改变
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