深圳市一起肠道病毒71型引发手足口病流行的基因型别分析

目的<\b>对2004年深圳市一起肠道病毒71型(Ev71)引发手足口病流行的基因型别分析。方法<\b>用EV71型特异性引物进行RT．PCR，并对EV71的VPl和VP4基因进行克隆，所得的序列与EV71型A、B、C基因型代表株的核苷酸序列用TreeView和PHYLIP软件(3．6b)进行系统进化分析。结果<\b>4株病毒与C基凶型代表株比较接近。VPl区核苛酸同源性在87．8％～92．0％之间，VP4区核苷酸同源性在85．9％--87．4％之间；与A、B基因型代表株比较差异较大，VPI区核苷酸同源性为81．9％--84．2％，VP4区为80．6％～85．0％；4株病毒VPl核苷酸同源性为94．1％～99．8％，vP4同源性为100％，组成一个独立的小分支。结论<\b>对EV71的VPI和VP4区进行基因进化分析，可得出类似的结果<\b>，4株Ev7l深圳流行株可命名为CA亚型