5株新疆出血热病毒分子流行病学研究

目的 从分子水平揭示中国新疆出血热 (XHF)病毒基因结构与功能的关系,寻找传播途径及流行原因。方法 对分离自新疆的 5株XHF病毒进行S基因片段的克隆和测序,与其他克里米亚 刚果出血热 (CCHF)的S基因序列进行比较和分析。 结果 5株病毒S基因全长均为 1672个核苷酸, 开放阅读框均为 14 4 9个核苷酸,编码一个含 482个氨基酸的蛋白。 新疆分离毒株的S基因核苷酸序列同源性 (93.0%～ 99.5% )明显高于其他国家分离毒株的S基因核苷酸序列。 系统发生树状图显示新疆毒株在一个分支之下形成独立的群体,明显区别于来自其他地区的CCHF病毒并且又进一步分为三组。结论 不同毒株的S基因序列差异不完全取决于病毒分离的宿主、地域和时间