宁夏地区2008年肠道病毒7 1型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征。方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养, 阳性标本进行RT-PCR鉴定后, 选取29株EV71分离毒株, 对其VPI区进行核苷酸序列测定, 并参考A、B、c各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树。结果 从439份标本中分离肠道病毒215株, 经RT-PCR鉴定, 93株为EV71。选取其中29株进行VPl基因全序列测定, 根据VPl全基闲序列构建系统发生树, 29株毒株均在c基因型中, 与c4亚型属同一分支, 与G4亚型代表株核苷酸同源性为91.7％～99.4％, 氨基酸同源性为96.6％一100.0％。结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属c基因型的c4亚型