2016年太原市5株人腺病毒53型病毒分离株基因特征分析

目的 对太原市人腺病毒53型（HAdV-53）病毒分离株进行基因特征研究。 方法 采集2016年山西省眼科医院门诊流行性角膜结膜炎（EKC）病例眼结膜拭子，共计79份，通过病毒分离和3个主要衣壳蛋白基因包括五邻体基座（Penton base）、六邻体（Hexon）和纤维蛋白（Fiber）的序列鉴定，共获得5株HAdV-53病毒株，同时下载GenBank数据库中全球流行的HAdV-53病毒株以及与HAdV-53相同基因来源HAdV病毒株的相应序列，建立3个基因的数据库，分别构建系统进化树，并使用生物信息学软件分析HAdV-53基因特征和分子进化特点。 结果 5株HAdV-53病毒株与1996—2014年间其他国家流行的HAdV-53病毒株在3个基因上显示了较高的一致性（>99.8%）。所有HAdV-53病毒株在Penton base和Fiber基因上分别与其重组来源基因型HAdV-37和HAdV-8处于同一进化分支，在基因序列上保持了高度一致性；在Hexon基因上，与其重组来源基因型HAdV-22亲缘性关系最近，核苷酸和氨基酸序列与HAdV-22高度同源，但处于不同的进化分支，HAdV-53进化分支的进化速率为3.51×10 -5替换/位点/年。 结论 HAdV-53目前已成为太原市重要的新的眼部感染性病原体，HAdV-53病毒株Penton base，Hexon和Fiber基因在进化上均具有保守和稳定的特性