2014年吉林省水痘-带状疱疹病毒基因特征分析

目的 分析吉林省水痘-带状疱疹病毒（VZV）野毒株的基因型别，区分疫苗株与野毒株。 方法 选择2014年1—12月在吉林省收集的13份疑似水痘患者的疱疹液或咽拭子样本。提取样本DNA，采用DNA PCR扩增病毒基因组的15个开放阅读框（ORF），结合单核苷酸多态性（SNP）法确定病毒株的基因型别；用PCR-限制性片段长度多态性聚合酶链反应（PCR-RFLP）方法区分野毒株与VZV减毒活疫苗（v-Oka疫苗株）。整理序列资料，从GenBank数据库下载VZV各基因型参考株的序列资料，采用MEGA5软件进行基因序列对比分析。 结果 13份疑似水痘患者的疱疹液或咽拭子样本中，5份来自男性，8份来自女性，患者年龄为（16.69±5.48）岁，范围为11~27岁，出疹后采样日期为0~3 d。13份疑似样本中，8份为VZV阳性。SNP分析显示，8份阳性样本均来自Clade 2遗传支；与v-Oka疫苗株相比，8份样本在SNP18082位点上均发生了T>C的同义突变。PCR-RFLP方法区分野毒株与疫苗株结果显示，8份临床样本均为野毒株（PstⅠ +BgⅡ +SmaⅠ -），无疫苗相关病例。 结论 吉林省流行的水痘-带状疱疹病毒均属Clade 2遗传支，且均为野毒株