2010–2012年广州市柯萨奇病毒A4、A10型VP1基因特征分析

目的 检测广州市2010–2012年手足口病(HFMD)病例粪便样本中的肠道病毒，并对其中的柯萨奇病毒A4型(CoxA4)和柯萨奇病毒A10型(CoxA10)VP1基因核苷酸序列进行进化分析。 方法 收集2010–2012年广州市HFMD疑似病例粪便样本5 484份，采用RT–PCR进行肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A16型(CoxA16)、CoxA4、CoxA10和其他肠道病毒阳性检测，阳性样本共4 111份。对其中的CoxA4及CoxA10阳性样本分别进行巢式RT–PCR，扩增肠道病毒VP1基因片段，并对VP1基因片段进行测序，利用生物信息学分析序列，构建系统进化树，进行进化分析。 结果 在4 111份肠道病毒阳性样本中，EV71、CoxA16、CoxA10、CoxA4的阳性率分别为35.1%(1 443/4 111)、30.7%(1 261/4 111)、2.0%(82/4 111)、0.8%(31/4 111)，不同肠道病毒阳性率差异有统计学意义(χ 2＝148.34， P <0.05)。CoxA4样本以3岁组阳性率最高，为1.3%(7/534)，CoxA10样本以0岁组阳性率最高，为3.7%(34/914)；CoxA4样本阳性率4月份达到高峰，为2.6%(12/460)，CoxA10样本阳性率8月份达到高峰，为4.3%(12/278)。VP1基因核苷酸遗传进化分析显示，CoxA4阳性样本VP1基因核苷酸序列可分为A、B 2个亚型，Cox A10阳性样本VP1基因核苷酸序列可分为A、B、C 3个亚型，广州市2010–2012年CoxA4和CoxA10阳性样本VP1基因核苷酸序列均属于A亚型。 结论 广州市2010–2012年HFMD病例粪便样本中CoxA4和CoxA10阳性样本VP1基因核苷酸序列均属于A亚型