植物乳杆菌LY-78乳酸脱氢酶基因的生物信息学分析

目的：探究植物乳杆菌LY-78菌株全部5 个乳酸脱氢酶基因及其编码蛋白质的结构和功能。方法：应用多种生物信息学软件对植物乳杆菌LY-78菌株的5 个乳酸脱氢酶基因及氨基酸序列进行结构分析和功能预测。结果：植物乳杆菌LY-78中5 个乳酸脱氢酶的核苷酸及氨基酸序列均具有较高的保守性，均为位于细胞质的热稳定性、非分泌、非跨膜蛋白，除了ldhL3基因，其余4 个基因均具有各自高度保守的功能位点和结构域，均存在典型的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（nicotinamide adenine dinucleotide，NAD＋）结合位点序列GXGXXG。结论：乳酸脱氢酶D1（D1-lactate dehydrogenase，D1-LDH）、D2-LDH、L1-LDH及L2-LDH均具有完整的功能位点和结构域，很可能具有真正的乳酸脱氢酶活性，L3-LDH由于缺失NAD＋结合结构域和功能位点，因而可能不具有乳酸脱氢酶活性，这些分析结果为今后植物乳杆菌乳酸脱氢酶基因改造和苯乳酸合成代谢机制研究提供了必要的理论基础