茶树肌动蛋白基因（CsActin1）全长cDNA克隆与生物信息学分析

摘要： 以茶树（Camellia sinensis）萌动芽为材料，根据茶树萌动芽芽抑制消减杂交文库中分离得到的肌动蛋白（actin）基因的5′-片段设计引物，利用3′-RACE技术克隆了其cDNA全长序列，该基因cDNA全长1 470 bp，命名为CsActin1（GenBank登录号HQ235647）。序列分析表明，CsActin1开放阅读框长1 134 bp，编码377个氨基酸，5′非编码区100 bp，3′非编码区236 bp。推测的蛋白质分子量为41.70 kD，等电点约为5.31，具有肌动蛋白家族的特征信号序列（YVGDEAQs.KRG和WIAKaEYDE）和肌动蛋白相关蛋白的特征信号序列（LLTEApLNPkaNR）。CsActin1与GenBank中注册的其它植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性在80%以上，氨基酸序列相似性在95%以上。与其它植物肌动蛋白的进化树分析结果表明，茶树肌动蛋白与杨树的两个肌动蛋白间的亲缘关系最为密切。并对推导的蛋白结构进行了分析