慈竹C3H基因克隆及其生物信息学分析

摘要： 香豆酸-3-羟化酶(C3H)是调控植物木质素生物合成的关键酶，本文以慈竹为材料，利用RT-PCR技术克隆慈竹C3H基因，并对其进行生物信息学分析，为通过基因工程手段降低工业用竹木质素含量奠定基础。结果表明，该cDNA序列全长为1 581 bp，编码区为1 539 bp，编码512个氨基酸，蛋白分子量为58.33KD，等电点为9.09；氨基酸序列和结构分析显示C3H有一个保守区域，即P450结构域。系统进化分析表明,该基因与毛竹和水稻的C3H基因具有很高的同源性。慈竹与毛竹和水稻C3H基因编码蛋白为亲水性蛋白，这三种编码蛋白很可能定位在内质网(膜)上，其编码蛋白的二级结构及三级结构都含有丰富的α-螺旋和无规卷曲，β-转角和延伸链的含量较少，都含有2个相对保守的无序化区域。该基因已在GenBank上注册,基因序列登录号为JF693629,可能与慈竹木质素的生物合成有关