植物萜类合成酶1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶的分子结构特征与功能预测分析

摘要： 采用生物信息学的方法和工具对已在GenBank上注册的拟南芥、玉米、岩蔷薇、水稻、黄花蒿、亚麻等植物的萜类合成酶1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶的核酸及氨基酸序列进行分析，并对其组成成分、转运肽、跨膜拓朴结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化关系等进行预测和推断。结果表明：该类酶基因的全长包括5′、3′非翻译区和一个开放阅读框，无跨膜结构域，是一个具转运肽的亲水性蛋白，包括两个功能DXR结合motif及两个功能NADPH结合motif，α-螺旋和不规则卷曲是蛋白质二级结构最大量的结构元件，β-转角和β-折叠散布于整个蛋白质中，蛋白质的功能域在空间结构上折叠成“V”形，“V”形的两臂由N-端与C-端构成，“V”形的底部，是N端臂与C-端臂的结合域