黄独微型块茎低温离体保存的转录组分析

摘要： 以黄独微型块茎为材料，进行了4℃低温离体保存，并对其进行了转录组分析。结果表明：原始数据进行质量预处理后，对照组（Con25）和处理组（Con4）的reads有效比分别为98.67%和98.69%；对拼接序列去重复后最终得到了219792个长度大于200bp的transcripts（177Mb）和161066个Unigenes（99Mb）；Unigenes的NR注释数目最多的10个物种分别为出芽短梗霉EXF-150、葡萄、可可、水稻粳稻组、无油樟、谷子、出芽短梗霉变种namibiae CBS 147.97、麻疯树、短至生黑醋杆菌CBS 110374和无花果拟盘多毛孢w106-1；样本注释基因最多的5个KOG是一般的功能预测、信号转导机制、翻译后修饰和蛋白质周转以及伴侣、翻译和核糖体结构和生物合成、能源生产和转换；样本KEGG注释Unigenes最多的5个pathway分别为碳代谢、氨基酸生物合成、糖酵解途径、淀粉蔗糖代谢和丙酮酸代谢。注释到的Unigenes个数为26006，注释到的不同酶数为1177，映射到的不同pathway数为327；样本基因的功能在Biological Process分类中主要聚集于cellular process和metabiolic process，在Cellular Component分类中主要聚集于cell和cell part，在Molecular Function分类中主要聚集于binding和catalytic activity；在黄独微型块茎低温离体保存中，共获得164145个差异表达基因，其中有63305个基因表达上调，有100840个基因表达下调；差异表达基因部分极其显著的GO term有液泡继承、单链断裂修复、纺锤体伸长、麦芽糖分解代谢过程、甘露糖基转移酶的活性、甘露糖磷酸转移酶活性、细胞壁甘露糖蛋白的生物合成过程、G1期细胞有丝分裂周期早期细胞芽和有丝分裂纺锤体定位的建立；差异表达基因部分极其显著的pathway有原发性胆汁酸的生物合成、类固醇激素的合成、氯代环己烷和氯苯降解、双酚A降解、氟苯甲酸降解、糖胺聚糖合成硫酸软骨素、糖胺聚糖合成硫酸乙酰肝素、甲苯降解、萘的降解和核黄素代谢。本实验结果可为黄独微型块茎的种质保存和后续萌发提供理论依据