悬钩子属DNA条形码通用序列的初步筛选

摘要： 为了建立悬钩子属（Rubus）植物的DNA条形码分子鉴定技术，筛选获得适用于悬钩子属植物的通用条形码序列。该研究基于GenBank数据对ITS、ITS2、matK、rbcL、trnH-psbA、trnL-trnF 6个DNA条形码序列进行了遗传变异、barcoding gap、建树等评估分析。结果显示，trnH-psbA、matK、rbcL、rtnL-trnF的种内变异与种间变异差异较大，变异分辨率分别为97.32%、83.33%、79.07%、64.95%，存在较大的barcoding gap；NJ一致树分析显示，matK的单系性比例最高（67%），其次为trnH-psbA（64%），rtnL-trnF（43%），rbcL（30%）。结果表明，悬钩子属植物的matK与trnH-psbA序列种内变异与种间变异差异较大，能较好地区分不同物种，具有较大的鉴定潜力。建议将matK和trnH-psbA作为悬钩子属植物鉴定的核心条形码序列，rtnL-trnF、rbcL作为辅助条形码序列