毛果杨NLP基因家族生物信息学分析与鉴定

摘要： NLP基因家族是一类特殊的转录因子，豆科植物根瘤的形成依赖于该基因家族的存在，在非豆科植物中具有调节植物硝酸盐吸收以及同化的功能。通过对毛果杨（Populus trichocarpa）基因组的生物信息学分析，共鉴定出14个毛果杨NLP基因家族成员，这些成员具有低亲水性的特点，基因结构保守，都含有RWP-RK以及PB1两个保守结构域。通过细胞定位预测，所有成员都定位在细胞核中。直系同源与旁系同源进化分析显示，NLP基因家族成员在漫长的进化过程中经历了严格的选择。染色体定位分析表明，毛果杨NLP基因家族成员坐落在毛果杨9条染色体之上，成员数量的扩增来自于杨柳科染色体自身的扩增事件。芯片数据分析结果显示，NLP基因家族成员在嫩叶，根和雄花中表达，部分基因在木质部以及种子萌发过程之中表达，但所有成员均不在成熟叶片中表达