迟钝爱德华氏菌Ⅲ型分泌系统效应蛋白功能域预测

　　采用 PCR 法检测了大菱鲆出血性败血症病原菌迟钝爱德华氏菌 L-49231菌株Ⅲ型分泌系统中的 eseB 、eseC 、eseD 基因，经 PCR 产物克隆测序；利用生物信息学方法对 eseB 、eseC 、eseD 表达蛋白的分子量、氨基酸组成、疏水性、跨膜结构、信号肽等进行初步预测和分析。结果显示，迟钝爱德华氏菌L-49231菌株 eseB 、eseC 、eseD 基因分别为：594、934、445 bp ，与 GenBank 中登录的迟钝爱德华氏菌PPD FL6-60菌株的 eseB 、eseC 、eseD 基因碱基序列的同源性分别为100％、100％、99％。 eseB 蛋白分子量为21732．26 u ，天冬氨酸含量最高，占10．61％；eseC 蛋白分子量为53606．08 u ，丙氨酸含量最高，占14．43％；eseD 蛋白的分子量为21112．43 u ，谷氨酰胺含量最高，占11．04％。3种蛋白质中甘氨酸、丙氨酸、亮氨酸含量都很高，而半胱氨酸、色氨酸含量都很低或缺少。3种蛋白均为亲水性蛋白质。eseB 无明显的跨膜结构；eseC 在192～210aa 、213～233aa 、263～284aa 处形成3个跨膜区域；eseD 在90～106aa 处形成一个跨膜区域。3种蛋白均不含信号肽