红笛鲷 M APKK5 基因的克隆及生物信息学分析

利用本实验室构建红笛鲷头肾cDNA文库中的 MAPKK5基因 EST 序列 ,通过 RACE PCR技术克隆红笛鲷MAPKK5基因cDNA全长(Ls-MAPKK5 ,登录号为KM657202).序列分析结果显示 ,Ls-MAPKK5 cDNA全长2632 bp ,其中开放阅读框1317 bp ,可编码438个氨基酸 ,预测其编码蛋白的分子量为49 .29 ku ,理论等电点为6 .12.SignalP 4 .0 、TMHMM Server 2 .0和SoftBerry-Psite预测结果显示 ,Ls-MAPKK5没有信号肽和跨膜结构 ,含有22个磷酸化位点.氨基酸序列分析显示Ls-MAPKK5具有保守的PB1与S_TKc结构域.利用MEGA5 .0软件 ,根据邻位相连法构建MAPKK5系统进化树 ,结果显示Ls-MAPKK5与雀鲷、吉富罗非鱼该蛋白有较近的亲缘关系