5种类型鲤鱼线粒体DNA D-loop及邻近区段的遗传多样性分析

采用PCR技术对乌克兰鳞鲤、德国镜鲤、框鳞镜鲤、红镜鲤和州河鲤共97尾个体的线粒体DNA Dloop及邻近区段进行了扩增，经测序后获得碱基顺序排列清晰的DNA片段，长度分别为1342、1343、1344 bp。共得到8种单倍型（GenBank序列号为MG786481~MG786483，MG786485~MG786487，KC292935，KC292936）。使用Mega 6.0软件计算出5个群体的组内及组间遗传距离,并构建邻接系统树。线粒体DNA Dloop及邻近区段、单独Dloop区段的碱基序列分析结果表明，单倍型Ⅰ至Ⅳ为欧洲血统，碱基差异位点数较多，变异程度较高；单倍型Ⅴ至Ⅷ为亚洲血统，碱基差异位点数较少，变异程度较低。在线粒体DNA D-loop及邻近区段内，德国镜鲤组内平均遗传距离为0.00462，核苷酸多样性指数为0.00458，平均核苷酸差异性为6.150，遗传多样性最大；州河鲤组内的平均遗传距离为0.00065, 核苷酸多样性指数为0.00065，平均核苷酸差异性为0.870，遗传多样性最低