脊尾白虾不同发育期线粒体基因组甲基化特征分析

为研究不同发育阶段脊尾白虾线粒体基因组表观遗传学特征，本研究在筛选硫化测序引物的基础上，对不同发育期的脊尾白虾线粒体基因组甲基化特征进行了分析。经引物筛选验证，选取了4对引物在脊尾白虾的受精卵、幼体期、仔虾期和成虾期共4个发育期进行甲基化特征的分析，结果表明，除ND5基因3′端序列（21#引物扩增区）无甲基化现象外，COX3基因的起始区序列（13#引物扩增区）、COX3基因的3′端序列（16#引物扩增区）和ND5基因5′端序列（19#引物扩增区）均存在不同程度的甲基化现象。其中，COX3基因的起始区序列仅在受精卵孵化期和幼体期存在甲基化现象，COX3基因3′端序列在除受精卵外的其他3个时期均存在甲基化现象，且以上甲基化率随个体发育阶段的提高呈下降趋势；ND5基因5′端序列在4个不同发育期均存在甲基化现象，但甲基化率无显著差异。甲基化主要发生在COX3基因和ND5基因位点上，推测脊尾白虾在生长发育过程中通过调节线粒体基因组甲基化来调节机体能量代谢过程。本研究首次从整个发育周期角度探讨了线粒体基因组甲基化特征，以期为进一步揭示甲壳类生长发育相关遗传机制提供帮助