青鱼、草鱼、鲢鱼和鳙鱼组蛋白 H2A N-端基因克隆及其衍生抗菌肽

采用RT-PCR方法，以青鱼、草鱼、鲢鱼和鳙鱼肌肉提取总 RNA 为模板，运用 GenBank中BLAST 同源性搜索，寻找亲缘关系相近的鱼类基因序列，采用Primer5设计简并引物，进行 H2A N-端序列扩增，通过胶回收和连接，然后转化到载体中进行克隆测序，分别获得青鱼、草鱼、鲢鱼和鳙鱼组蛋白 H2A N-端基因序列，长为364 bp ，分析发现均属于不稳定蛋白质，等电点为10．48～11．02，平均亲水性为0．179～0．264。序列同源性比对结果显示，青鱼、草鱼、鲢鱼和鳙鱼同狭孔金线鲃和斑马鱼基因H2A编码蛋白质同源性极高，达到85％以上，与其他物种同源性较低，其中狭孔金线鲃与青鱼、草鱼、鲢鱼和鳙鱼的亲缘关系比斑马鱼更近，分子系统学分析也支持这一结果。青鱼、草鱼、鲢鱼和鳙鱼H2A衍生抗菌肽与庸鲽 Hipposin抗菌肽同源性极高，不仅存在碱性氨基酸，还存在酸性氨基酸。组蛋白 H2A N-端可衍生 Hipposin类抗菌肽，均为阳离子α螺旋结构抗菌肽