基于miRNA-靶位点配对的序列特征研究

miRNA与其靶基因的作用机制十分复杂，因此，miRNA靶基因识别问题一直是miRNA研究领域的热点难题。该文基于CLASH数据集，提出了miRNA-靶位点配对序列特征，并使用随机森林建模。实验结果表明，本模型的Acc，Sen，Spe，Pre以及Mcc分别达到90.05%，89.47%，90.56%，90.43%和0.799 8；ROC和PRC的AUC分别为0.954，0.958。相比已有方法，该方法表现出更加良好的性能，说明新引入的miRNA-靶位点配对序列特征对miRNA靶基因识别有很重大的影响