三斑海马线粒体基因组核苷酸全序列结构与分析

通过PCR扩增并测序获得了三斑海马（Hippocampus trimaculatus）线粒体DNA（mtDNA） 全序列。结果显示，三斑海马线粒体基因组全序列长度为16534bp（GenBank登录号为KJ956892），编码37个基因，包括 13 个蛋白编码基因、22 个 tRNA 基因、2 个 rRNA 基因和 1 个控制区（D-loop）及一个轻链复制起始区域。大部分基因由H-链编码，包括14 个 tRNA 基因、2 个 rRNA 基因、12个蛋白编码基因，只有ND6 和8个tRNA基因是在L-链编码。预测的22个tRNA基因的二级结构均为典型的三叶草状。基因间隔一般从 1 到 14 bp不等，此外还存在7处碱基重叠，其中四处是鱼类和脊椎动物典型的基因重叠位点（ATP8 and ATP6，ATP6 and COIII，ND4L and ND4，ND5 and ND6）。总的碱基含量分别为A：32.7%；C：23.4%；G：14.6%；T：29.3%，A+T含量为 62.0%，其线粒体基因组序列的结构与脊椎动物的典型结构近似。邻接法和贝叶斯法构建的三斑海马系统进化树中的拓扑结构相似，这与现有的三斑海马的系统演化地位一致