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中南民族大学学报(自然科学版) 2018
茶藨子属ITS2序列二级结构的预测和比较分析Keywords: 茶藨子属 ITS2 二级结构 聚类分析 Abstract: 目的:利用内转录间隔区2(ITS2)序列对茶藨子属30个物种进行分类鉴定.方法:利用Clustal W 软件多序列比对分析从Genbank上下载的ITS2序列,通过MEGA7.0软件计算遗传距离(K2P),基于K2P模型构建邻接(NJ)聚类树,并用RNA Structure5.4软件分析各物种ITS2二级结构的差异.结果:从构建的聚类树可知,茶藨子属30个物种均聚为1大枝11个小分枝,说明茶藨子属是一个单系类群;根据 ITS2 的二级结构分析,该属所有物种都均具有相似的结构,说明了该属的特异性较强,同时也说明了 ITS2 序列分析适用于茶藨子属植物的分类鉴定,并在近缘物种间的系统学研究、物种的鉴定方面具有较大的应用潜力
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