麻竹笋转录组测序及苦涩味物质合成基因差异表达分析

[目的] 研究避光处理对麻竹笋苦涩味物质合成相关基因表达的影响。[方法] 利用Illumina HiSeqTM 2500平台对自然生长（CK）和覆土处理（EP）2种类型的麻竹笋进行转录组测序，并对差异表达基因进行分析。[结果] 转录组测序共获得36.45 Gb原始数据，经组装去冗余处理得到53 388个Unigene，将所得Unigene比对到Nr、Pfam、COG、Swissprot、GO和KEGG数据库中进行功能注释，发现共有31 462条Unigene与其它物种的基因具有同源性。对CK和EP处理所测得的Unigene进行表达量的比较分析，筛选出1 846个差异基因，其中，在EP处理中上调表达基因998个，下调表达基因848个。由KEGG代谢通路分析发现，差异基因显著地富集在32个代谢途径中，其中，包含与苦涩味物质合成相关的糖酵解途径、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸合成途径等。进一步研究发现，参与麻竹笋芳香族氨基酸、单宁合成的PFK、ENO、PPY-AT/HPP-AT、LAR等酶基因在EP处理中表达量下降，荧光定量PCR验证结果与测序结果基本一致。[结论] 避光处理抑制了苯丙氨酸、酪氨酸、单宁生物合成关键酶基因的表达，可能最终影响麻竹笋苦涩味物质的合成