中间锦鸡儿CiDR1的克隆及干旱胁迫下的表达分析

[目的]研究并了解中间锦鸡儿CiDR1基因功能及其对干旱胁迫的响应，为抗性育种提供候选基因。[方法]通过RACE技术从中间锦鸡儿中克隆CiDR1基因的cDNA全长，利用生物信息学分析软件对其基因结构及功能进行分析和预测。再通过qRT-PCR技术对干旱胁迫后的幼苗中的CiDR1表达模式进行研究。[结果]从中间锦鸡儿中克隆到CiDR1基因的cDNA全长共计4 297 bp，GenBank登录号为KP277100。生物信息学分析表明，预测的CiDR1蛋白序列中含有1 243个氨基酸残基，具有抗病基因特征结构域TIR、NB-ARC、LRR等，其等电点为6.35，不稳定指数为42.91，不具备信号肽，为非分泌蛋白，定位于细胞质中。定量PCR检测发现，CiDR1基因在幼年期的茎中表达量较低，在成年期的叶片中表达量较高；在干旱胁迫处理后的幼苗中，CiDR1表达水平有明显下降，表明该基因的表达受干旱抑制，可能与中间锦鸡儿适应干旱相关。[结论]中间锦鸡儿在干旱胁迫后其根、茎和叶中CiDR1的表达均明显下降，表明CiDR1的表达受干旱抑制，可能与中间锦鸡儿适应干旱相关，进一步研究发现CiDR1在根、茎、叶中的表达水平可能受发育阶段调控