基于沙棘转录组序列开发EST-SSR分子标记

[目的] 本研究通过对蒙古沙棘“向阳”品种的转录组序列进行SSR引物开发，为沙棘亲本分析、遗传多样性和遗传育种等研究提供支持。[方法] 利用已测得的转录组序列进行分析和筛选，整理具有SSR位点的序列，进行引物设计，随机挑选179条引物进行验证。[结果] 得到具有SSR位点的EST序列17 383条，其中，单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复基元分别占62.77%、21.82%和13.77%；二核苷酸重复基元类型以AT和AG为主，三核苷酸重复基元类型以AAG、ATC和ATA为主。9 291条序列设计出扩增EST-SSR位点的引物，随机合成的179对引物中，142对扩增成功，选取其中92个位点的扩增产物上机检测，40个SSR位点（43.48%）呈现多态。对扩增稳定且峰图清晰的17个多态位点的进一步分析，得到蒙古沙棘天然群体在各位点的观测杂合度（HO）为0.083 0.875，期望杂合度（HE）为0.180~0.750。[结论] 本研究开发出的EST-SSR标记，为后期进行沙棘属植物遗传多样性分析、遗传图谱构建及分子育种等研究提供了重要支持