忍冬属黄酮合成酶基因FNSII的SNP分析

为挖掘鉴别金银花与山银花的黄酮合成酶基因(flavone synthase II gene，FNSII)SNP位点，以基源确定的5个忍冬属(忍冬、灰毡毛忍冬、红腺忍冬、黄褐毛忍冬、华南忍冬)共计12个样本为研究对象，采用同源克隆法从各忍冬属植物中克隆FNSII基因，分析不同忍冬属植物中的SNP位点。结果显示：克隆分离到的各忍冬属FNSII基因的同源性和相似性高达95%以上；成功克隆获得红腺忍冬、黄褐毛忍冬和华南忍冬的FNSII序列；系统进化分析表明，获得的忍冬属序列与基源鉴定结果一致；通过序列比对，从12个样本中克隆得到的20条FNSII序列中鉴定到38个SNP位点，其中19个SNP位点可用于区分各种属，依据各种属间SNP的差异进行分型，获得5种基因型