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ISSN: 2333-9721
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商陆PaHAK1与拟南芥HAK/KUP/KT家族基因的比较分析

Keywords: 商陆 拟南芥 PaHAK1 HAK/KUP/KT 高亲和性钾离子转运体 生物信息学分析

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Abstract:

为探明商陆高亲和性K+转运体基因(PaHAK1)的结构、功能及商陆耐低钾的原因,分析比较了商陆PaHAK1和拟南芥HAK/KUP/KT家族基因中15个基因编码的高亲和性钾离子转运体氨基酸序列、蛋白质结构及其理化性质。结果表明:HAK基因家族编码蛋白均定位于细胞膜上,含有多个跨膜结构且跨膜结构域是蛋白质的保守结构域;PaHAK1与AtKUP3的跨膜结构十分相似,低钾胁迫下PaHAK1和AtKUP3的高表达与其高亲和钾转运吸收功能密切相关。系统进化树分析结果表明,PaHAK1与拟南芥HAK基因家族中AtKUP8亲缘关系最近,其氨基酸序列相似度为76.98%,推测PaHAK1还可能通过维持细胞内高水平钾量在水分胁迫下发挥重要的调节作用

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