甜荞热激转录因子基因家族的鉴定及生物信息学分析

利用Blastp比对程序对甜荞基因组数据库进行搜寻，共鉴定到23个甜荞HSF基因。基因结构分析显示，所有HSF基因都含有内含子，且大部分基因只含有1个内含子。蛋白序列多序列比对分析表明，23个HSF蛋白均含有氨基酸序列高度保守的DNA结合域(DNA–binding domain, DBD)和不保守的寡聚化结构域(oligomerization domain, OD)。蛋白保守基序分析表明，23个HSF蛋白共包含10个保守基序，基序长度为11~62个氨基酸，其中基序1、2和3代表DBD区。亚细胞定位分析表明，除FeHSF13、FeHSF14和FeHSF18同时定位于细胞核和细胞质上，其余20个FeHSF蛋白均定位于细胞核上。磷酸化位点分析表明，所有HSF蛋白均含有潜在的丝氨酸(Ser)和苏氨酸(Thr)磷酸化位点，部分HSF蛋白还含有酪氨酸(Tyr)磷酸化位点。系统发育分析表明，23个HSF基因可以分为A、B和C 3类，进一步细分为A1、A3、A4、A5、A6、A7、A9、B3、B4和C共10个亚类