盐碱胁迫下玉米EST数据库对比分析

提取了盐碱胁迫处理的玉米YQ7-96品系3叶1心期的叶茎混合组织总RNA，运用SMART技术构建pDNR-LIB载体的cDNA文库，并随机挑选克隆进行EST序列的BlastX比对和MIPS归类分析。结果发现，在随机挑取的2个4 000个cDNA克隆测序中，95.0％的EST符合分析要求(长度大于150 bp，非rRNA)，共获得3 217条拥有BlastX注释信息的EST序列，盐碱胁迫的EST数据库归类的比例信息比较接近。其中维持正常生理活动占比分别为50.63％(盐胁迫)和52.79%(碱胁迫)，参与细胞内运输、细胞内信号传导、细胞防御和细胞循环和DNA代谢过程的基因分别为22.05％(盐胁迫)、19.03％(碱胁迫)，参与能量代谢和转录相关的基因分别为15.77％(盐胁迫)、15.36％(碱胁迫)。本研究构建的盐碱胁迫下玉米cDNA文库及相关基因表达分析结果，为后续研究提供了基础数据