加利福尼亚兔和新西兰兔UCP1基因第5外显子 多态性和生物信息学研究

本试验以加利福尼亚兔和新西兰兔为研究对象，分别用磁珠法动物基因组DNA抽提试剂盒提取新西兰兔和加利福尼亚兔的DNA，通过构建DNA池，扩增UCP1基因的第5外显子及第4内含子部分序列。扩增产物进行双向测序，利用DNAStar和BLAST分析测序结果。结果发现：在加利福尼亚兔中没有发现SNP位点，在新西兰兔中有4个多态性位点，分别为G743T、A744G、C819A和G849T，其中G743T为同义突变，A744G为错义突变，导致编码的苏氨酸(Thr)变为丙氨酸(Ala)；C819A、G849T突变位点位于内含子区。多态位点的出现对UCP1基因的RNA二级结构产生的影响表现在其最小自由能由-1.93 MJ/mol变为-1.932 MJ/mol，同时SNPs位点对UCP1基因蛋白结构也有一定影响