猪akirin2基因的组织表达谱及序列分析

克隆猪的akirin2基因，并对该基因在猪的18个组织中的分布进行研究。猪akirin2基因编码区全长为612 bp (GenBank登录号KC140110.1)，推测的氨基酸序列包含203个氨基酸，为酸性蛋白。利用BLAST工具对克隆到的猪akirin2基因序列与人、大鼠、小鼠、绵羊和牛的序列进行同源性比较。采用软件对氨基酸序列进行分析，用相关序列的比对结果进行系统进化树分析。组织分布结果显示，猪akirin2基因在脑组织中高表达，在淋巴、睾丸中表达量相对较低，在心脏、十二指肠、直肠、皮肤、胸腺中几乎检测不到该基因的表达。序列分析结果显示，猪akirin2基因与绵羊和牛的同源性最高，均为96%，与人、小鼠、大鼠的同源性分别为95%、91%、89%。氨基酸序列分析发现，存在1个10个肽的核定位信号序列19-PASPKRRRCA-28，推测的氨基酸序列的二级结构中含有2个a-螺旋。在重建的系统进化树上，几个不同物种的akirin2蛋白分成3支，结果表明猪akirin2与人、牛和羊的亲缘关系比其与小鼠和大鼠的近，与鸡的亲缘关系最远