利用小RNA深度测序技术鉴定半夏病毒病病原

RNA沉默是真核生物体内由病毒来源的干扰小RNA（virusderived small interfering RNA, vsiRNA）沉默复合物介导目标RNA特异降解的一种保守机制，通过对vsiRNA分析可进行植物病毒病原鉴定。本文利用小RNA深度测序技术对感病半夏叶片进行鉴定，结果发现，表现典型花叶症状的半夏叶片受到大豆花叶病毒（Soybean mosaic virus, SMV）、黄瓜花叶病毒（Cucumber mosaic virus, CMV）、芋花叶病毒（Dasheen mosaic virus, DsMV）、魔芋花叶病毒（Konjac mosaic virus, KoMV）、烟草花叶病毒（Tobacco mosaic virus, TMV）等多种病毒的复合侵染。为明确SMV山西半夏分离物（SMV-SXBX）的进化关系，进行SMV-SXBX全基因组克隆与分析，获得SMV-SXBX全长为9 735 nt，编码一个由3 105个氨基酸组成的多聚蛋白质。通过核苷酸与氨基酸序列比对发现，SMV-SXBX与半夏分离物P同源性最高，分别为91.1%和94.1%，且系统发育分析表明，SMV-SXBX与半夏SMV分离物P聚为一簇。同时，也对vsiRNA进行了系统分析，研究结果有望为半夏SMV的有效防治提供一定科学依据