细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析

【目的】克隆细粒棘球蚴(Eg)内质网膜蛋白4(Reticulon 4，RTN4)抗原基因，对其序列进行生物信息学分析。【方法】采集感染Eg的绵羊肝脏和肺脏，提取Eg头节总RNA为模板，对RTN4基因进行RT-PCR扩增，将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序，对其核苷酸序列及氨基酸序列进行生物信息学分析。【结果】Eg RTN4 cDNA全长654 bp，编码217个氨基酸，蛋白质分子质量为25.3 ku，等电点为8.83。编码氨基酸序列中含有1个N端酰基化位点、2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和4个蛋白激酶C磷酸化位点。经生物信息学软件预测，RTN4蛋白的抗原表位区主要集中在第1-47位、第71-147位和第171-217位区域；含有2个高度疏水区，2个跨膜区，膜外区分别位于第1-47位和第171-217位。【结论】成功克隆了Eg RTN4基因，预测了其编码蛋白抗原的结构和表位