牛PRKAA2基因SNP检测及与其生长和肉质性状的关联分析

【目的】研究秦川牛、南阳牛、鲁西牛和安格斯牛共630头个体的单磷酸腺苷激活的蛋白激酶α2亚基(AMPKα2)基因PRKAA2的多态性，并分析其多态性与200头秦川牛生长及肉质性状的关联性。【方法】利用PCR-SSCP、DNA测序、飞行质谱(MALDI-TOF)等技术，分析检测4个品种牛PRKAA2基因6个外显子的单核酸多态性（SNPs）；采用生物信息学方法结合统计分析软件，分析秦川牛各多态位点的遗传变异特性与体尺及肉质性状的关联性。【结果】PRKAA2基因第2、4、6、7、8、9外显子中，只检测到第4外显子27 G>C和60 T>C 2个突变位点；关联分析表明，27 G>C位点与秦川牛背膘厚和眼肌面积显著关联(P<0.05)；60 T>C位点与秦川牛体斜长极显著相关(P<0.01），与体高、尻长、腰角宽、坐骨端宽、眼肌面积显著相关(P<0.05)。【结论】PRKAA2基因对秦川牛部分体尺及肉质性状有极显著或显著影响，可作为秦川肉牛新品种早期选择的候选基因和分子辅助标记