林麝肺炎克雷伯氏菌的分离鉴定及其kp05372基因的生物信息学分析

【目的】对1株疑似肺炎克雷伯氏菌进行分离鉴定及全基因测序分析，并对发现的新基因kp05372编码产物进行生物信息学分析。【方法】采用传统的细菌鉴定方法和分子生物学方法，分别对采自麝粪便的1株病原菌的生理生化特征及16S rRNA序列进行测定；以小鼠感染试验和半数致死量 (LD50)测试该病原菌的致病性；用全基因组测序方法对病原菌基因组进行测序分析，并对发现的新基因编码产物进行生物信息学分析。【结果】经生理生化试验和16S rRNA序列分析发现，分离菌株为肺炎克雷伯氏菌，命名为GPKP，其对小鼠致死的LD50为6.3×107 CFU/mL。该菌基因组大小为4 879 707 bp，包含5 490个开放阅读框，共注释到22组COG功能。kp05372基因编码产物由302个氨基酸组成，无信号肽，是一种不稳定的、在细胞内发挥生理作用的亲水性蛋白。【结论】分离的细菌为肺炎克雷伯氏菌，kp05372基因编码产物属于典型的LysR家族转录因子(LTTR)