2006 - 2015年江西省风疹病毒野毒株基因特性研究
Study on the genetic characteristics of rubella virus wild strains from 2006 to 2015 in Jiangxi

目的 研究江西省近10年风疹病毒野毒株的基因特性,为江西省的风疹防控提供技术支撑。方法 采集江西省2006 - 2015年风疹疑似病例咽拭子标本，用Vero/SLAM细胞对标本进行病毒分离培养，再对细胞分离物进行核酸的提取，采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）对细胞分离物进行风疹病毒核酸鉴定，采用RT-PCR对风疹病毒核酸检测阳性标本扩增病毒糖蛋白E1基因，对其核苷酸序列进行测定，运用生物学软件对测定序列进行处理分析。结果 江西省2006 - 2015年风疹病毒野毒株分属于2个基因型：1E基因型（14株）和2B基因型（20株），1E基因型为江西省2005 - 2013年风疹病毒流行唯一基因型，并在2015年被2B基因型替代。1E和2B基因型各毒株之间E1基因核苷酸同源性分别为97.6%～99.9%和99.2%～99.9%，与疫苗株BRDII株核苷酸同源性分别为89.4%～89.9%和92.6%-93.0%，氨基酸同源性为98.8%～99.6%；氨基酸序列相对保守，未发现重要抗原位点的改变。结论 1E基因型和2B基因型为江西省2006 - 2015年风疹病毒流行的基因型，2B基因型为2015年首次在江西省发现，并为当年的绝对优势基因型。