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- 2017
8种快速制备细菌基因组DNA方法的效果评价
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Abstract:
目的 探索用于革兰阴/阳性细菌基因组DNA制备的快速、简便、经济方法。方法 采用水煮沸法、碱煮沸法、碱 - SDS - 煮沸法、丙酮 - SDS - 煮沸法、NP - 40 - 煮沸法、Triton - 100 - 煮沸法、SDS - 煮沸法、Triton - 100 - NP - 40 - 煮沸法制备大肠埃希菌和金黄色葡萄球菌DNA,观察不同方法所得DNA的量、分子大小、纯度以及用其作为模板进行实时荧光定量PCR扩增反应效果。结果 与其他方法比较,碱 - SDS - 煮沸法、丙酮 - SDS - 煮沸法和SDS - 煮沸法得到的DNA量较多、DNA分子较大、纯度较好;碱 - SDS - 煮沸法上清液DNA含量最大及PCR扩增效果最佳,水煮沸法所得DNA含量显著低于其他方法,差异有统计学意义(P<0.05)。各方法煮沸5 min与10 min所得DNA量和PCR检测DNA的循环阈值均无统计学差异(P>0.05),煮沸10 min的DNA液中有机杂质增多。结论 碱 - SDS - 煮沸法煮沸5 min制备细菌基因组DNA的效果最优,水煮沸法效果最差。